Die Blaue Lagune ist eigentlich gar keine Lagune, sondern ein schmaler Kanal aus flachem Meerwasser zwischen der Insel Comino und der kleinen Insel Cominotto. Der Meeresboden besteht hier aus hellem Sand, und das durch das Wasser fallende Sonnenlicht bricht sich in dem Türkis, das der Meerenge ihren Namen gibt.
Comino selbst ist etwa 3,5 Quadratkilometer groß, und die ständige Bevölkerung ist auf eine Handvoll Einwohner geschrumpft.
Die Insel hat ihren Namen von Kreuzkümmel (Cumin), dem Gewürz, das einst auf ihren Terrassen angebaut wurde. Jahrhundertelang diente Comino den Johannitern als Jagdrevier und Quarantänestation; der Santa Marija Tower, eine gedrungene Küstenfestung, die 1618 unter Großmeister Alof de Wignacourt erbaut wurde, wacht noch heute über die Zufahrt. Boote, die die Bootstour zur Blauen Lagune von Malta ab St. Paul's Bay anbieten, fahren bei der Einfahrt unter diesem Turm hindurch und folgen einer Route, die Fischer und Schmuggler schon lange vor dem Einzug des Tourismus in den Kanal nutzten. Eine Bootstour zur Blauen Lagune von Malta ab St. Paul's Bay folgt heute derselben Kalksteinküste, vorbei an Meereshöhlen, die in die Klippen von Comino und der Nachbarinsel Gozo gegraben wurden.
Gozo, die größere nördliche Insel, bildet den Anker des weiteren Archipels, den diese Bootsfahrten erkunden. Die Ġgantija-Tempel sind älter als die Pyramiden von Gizeh, und die Kristalllagune – eine tiefe, geschützte Bucht nahe Comino – hat ihren Namen von der Klarheit ihres Wassers. Viele Routen von Comino-Bootsfahrten verbinden beide Orte und vereinen das flache Türkis des Hauptkanals mit dem dunkleren Saphirblau der Höhlen. Die Comino- und Blaue-Lagune-Bootsfahrt ist zum Inbegriff des Tagesausflugs im maltesischen Sommer geworden, und die umliegenden Gewässer gehören zu einem ausgewiesenen Meeresschutzgebiet.
Die Geologie erklärt die Farbe. Cominos Küste besteht aus Globigerinen- und Korallenkalkstein, porös und hell, und der flache Sockel reflektiert das Licht durch das ungewöhnlich klare Mittelmeerwasser nach oben. Es gibt keine Flussmündungen, die das Wasser trüben könnten. Schnellboot- und Katamaranbetreiber, die in den nördlichen Buchten ablegen, bringen seit Jahrzehnten Besucher hierher, und Bootsfahrten nach Gozo, Comino und zur Blauen Lagune gehören nach wie vor zu den gefragtesten Erlebnissen auf den Inseln. Die Kapelle in der Santa Marija Bay, der Kanal der Blauen Lagune und die Höhlen bilden zusammen einen kleinen Archipel, der Schwimmer, Maler und Filmteams gleichermaßen anzieht – die Meerenge diente in mehr als einer Spielfilmproduktion als Kulisse für den offenen Ozean.
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